Mereka Juara Liga Nusantara Tahun lalu Zona Timur

Foto Nabire Putra Fc sebelum berlaga melawan tim tuan rumah Bone Fc di Makassar

Sala satu kebijakan PSSI Pusat di masa transisi adalah menginstrusikan kepada seluru Asosiasi Provinsi (Asprov) PSSI untuk menggelar kompetisi Liga Nusantara.Kompetisi tersebut berputar di seluruh masing-masing Provinsi di Indonesia dengan menghadirkan semua klub-klub resmi yang terdaftar di Asprov.untuk itu Asprov PSSI Papua sudah dan telah merealisasikan kepijakan PSSI tersebut sehingga wajah Liga Nusantara ini muncul pada pada tahun 2013 dengan sistem kompetisi ISL(Indonesia Super Liga) yang kini sudah di rubah (QNB League).

Pada Tahun 2013 lalu pertama kali bergulirnya Liga Nusantara yang bersamaan dengan piala Gubernur Cup I-Papua yang di gelar di Jayapura Stadion Mandala.Tim Nabire Putra sebagai salah satu klub baru yang saat itu terdaftar di PSSI pusat dan ikut berlaga di ajang Liga Nusantara lalu.Tim julukan The Black Gold ini menggumpulkan poin yang tinggi sehingga telah memastikan lolos ke putaran perempat final bertemu dengan saudaranya Persipuja Puncak Jaya dan Tim Nabire Putra memenangkan partai semi final dengan skor telak 3:0,sehingga Nabire Putra Fc lolos ke Partai Final menghadapi Persami sarmi dan berakhir dengar skor 3:2 untuk Nabire Putra sehingga dengan satu kemenagan ini Tim Nabire Putra menjuarai liga Nusantara tahun 2013 dengan mendapatkan piala berglir dan piala tetap gubernur Papua.

Tim Nabire putra dimanejeri oleh Inarius Douw dan pelatinya Gad Tekege,sebelum terlahirnya Nabire Putra di daerah Inarius menagani sebuah klup yang dinamai Wadouw Fc dan Wadouw fc ini dapat dilatih asuh oleh Gad Tekege.banyak prestasi yang dibuat Wadouw Fc di daerah melalui berbagai iven-iven.